Ich vermute mal, da er das als Logon-Script nutzen will - soll es für alle / viele Benutzer ausgeführt werden.
Dann müsste auf allen Rechnern der Benutzer auch Autoit installiert sein - sonst weiß deren rechner nicht was eine .au3 Datei ist.
Bei Kixtart hat man die Runtime einfach dazu kopiert.
Komplizierte Lösung: Du kopierst die AutoIt-Runtime und alle Include-Skripte auch nach Netlogon, die Includes stellst du alle um auf ""
Der Aufruf für die Benutzer muss ähnlich wie bei Kixtart mit "autoit3.exe deinskript.au3" erfolgen, ggf. mit Pfaden
Einfache Lösung: Du kompilierst das Skript einfach (machst eine .exe daraus). Das Ding ist dann komplett allein für sich lauffähig ohne irgendwelche Voraussetzungen auf den Clients.
Den Quellcode kannst du ja auch im Netlogon ablegen - und lässt die .exe auch nach dorthin erzeugen. So kannst du von deinem Admin-PC es schnell ändern.