Ich habe in AutoIt zwar noch nie mit SqLite gearbeitet (nur in js,perl und delphi), aber:
Wie wäre es mit einem REPLACE INTO anstatt INSERT INTO ? (Alternativ auch INSERT OR REPLACE INTO...)
http://www.sqlite.org/lang_insert.html
bzw. ein "INSERT OR IGNORE INTO" ?
http://www.sqlite.org/lang_conflict.html