Moin Tweaky,
"nativ" bedeutet in diesem Zusammenhang "ohne Emulation". Also, daß deine Scripte für x64 "kompilliert" werden und somit natürlich nur auf eben solchen Systemen laufen.
Zur zweiten Frage: Das bezieht sich auf deine erste Frage. Installierst Du die 32bit AutoIt-Version auf deinem 64bit System, dann hast evtl. Performanceverluste.
Was dir 64bit bringt ? Den größeren Adressraum deines Prozesses, zum Beispiel.
Weitere Infos:
http://www.autoit.de/dokumentation_…bit_support.htm
Gruß
Greenhorn