Ich gehe mal davon aus, dass Deine CSV-Datei als Zeilenende nicht nur Chr(13) = CR, sonder Chr(13) + Chr(10) = CRLF enthält.
Demzufolge muss die Zeile 7 so aussehen:
$array=StringSplit($content, Chr(13) & Chr(10), 1)
[/autoit]
oder so:
$array=StringSplit($content, @CRLF, 1)
[/autoit]