jede 3. Zeile soll eine Leerzeile sein

Man kann das grundsätzlich auf zwei Arten lösen... Einerseits kann man mit Programmierlogik und den normalen String-Funktionen arbeiten. Das ist gut verständlich und machbar. Eleganter ist es aber meistens, StringRegExp zu nutzen. Damit kann man sowas prinzipiell in einer Zeile abhandeln, das ist aber schwieriger, fast schon eine eigene Sprache. Ich würde dir daher erstmal die String-Funktionen empfehlen. Dabei würde sich dann die folgende Grundlogik anbieten, in Klammern immer ein paar Stichwörter: Datei lesen (FileRead), Array erstellen (StringSplit), in Schleife einen neuen Dateiinhalt erzeugen (For-Schleife) und in jedem dritten Schleifendurchlauf (Mod) eine Leerzeile einfügen, dann alles zurückschreiben (FileWrite).

$aFile = StringSplit(FileRead("file.txt"), @CRLF, 3)
$iCount = 0
For $i = 0 To UBound($aFile) - 1
If $iCount = 3 Then
FileWrite("file_new.txt", @CRLF)
$iCount = 0
EndIf
$iCount += 1
FileWrite("file_new.txt", $aFile[$i] & @CRLF)
Next

z.B. so (ungetestet):

local $Array
_FileReadToArray("datei",$Array)
fileopen($file,2)
for $i=0 to UBound($Array)-1 step 1
	FileWriteLine($file,$Array[$i])
	if mod($i+1,3)=0 then
		FileWriteLine($file,"")
	endif
next

Das hat schon was, Funktionene aus UDFs verwenden aber die UDF selber nicht includen

StringregexpReplace dürfte wohl eine der schnellsten Möglichkeiten sein, man muss sich aber etwas Zeit zum reinarbeiten nehmen^^
Hier ein Beispiel wie es mit StringregexpReplace möglich ist:

$sString = FileRead("File.txt"); Liest eine Textdatei aus
$sString = StringRegExpReplace($sString,"(([^\v]*\v){3})","\1" & @crlf); Ersetzt jewals 3 Zeilen Text durch 3 Zeilen Text + eine Leerzeile
$hFile = FileOpen("File.txt",2); Offnet die Textdatei im Überschreiben modus
FileWrite($hFile,$sString); Überscheibt den inhalt der Datei
FileClose($hFile); Schließt die Datei wieder

€Edit: Funktioniert so nur bei @CRLF als Zeilenumbruch

Fals du dich dafür interessiert kannst du dir mal folgende Seiten duchlesen:
StringRegExpReplace
StringRegExp

@alpines ach, man sollte es schaffen, auf einem Befehl F1 zu drücken und nachzusehen, welcher include denn oben steht ;D (war ja auch ungetestet -> hatts vergessen)

@alpines,

und ausserdem gibts OrganizeIncludes, damit erspart man sich das Include-Gesuche generell.